Родился 26 мая 1977 года в Баку. Окончил Бакинский Государственный Университет. В 2006 году получил степень кандидата филологических наук. Научно-педагогической деятельностью занимается с 2007 года. С 2019 года имеет ученое звание доцента.

Ю. Агаев начал свою трудовую деятельность в 2001 году. С 2003 года работал на различных руководящих должностях в Академии государственного управления при Президенте Азербайджанской Республики. Одновременно он был председателем профсоюзного комитета Академии государственной службы.

С 24 января 2025 года по настоящее время работает проректором по «учебной работе» Азербайджанской академии труда и социальных отношений и временно исполняет обязанности ректора.

Он является автором 5 книг и 42 научных статей.

Женат, имеет троих детей.