Магистратура организует учебный процесс, соответствующий образовательным стандартам на уровне магистратуры. С сентября 2022 года он функционирует как отдельное подразделение. В настоящее время кафедра принимает заявления на специальности «Экономика», «Финансы», «Учет и аудит» и «Социальная работа» (специализации: «Регулирование экономики», «Оценочная деятельность», «Экономика туризма», «Банковское дело», «Учет и аудит в сфере услуг», «Финансовые рынки», «Организация страхового дела», «Социальная работа в различных сферах жизнедеятельности», «Работа с молодежью»).
Кафедра организует обучение в магистратуре на основе принципов «Болонского процесса», готовит научно-педагогические кадры, привлекает профессорско-преподавательский состав к образовательному процессу магистратуры, организует всероссийские и международные конференции, семинары и научные дискуссии для магистрантов, использует в учебном процессе получение и применение новых научных знаний и технологий в образовании, экономике и социальной сфере, осуществляет интеграцию образования, науки и производства путем создания взаимовыгодных связей между научно-исследовательскими и научно-педагогическими, а также инновационными организациями.
Отдел готовит и руководит планами мероприятий, доводит соответствующую информацию до преподавателей, сотрудников и студентов, работающих в Академии, а также контролирует результаты деятельности. Кафедра работает в тесном сотрудничестве с кафедрами «Экономики и менеджмента», «Финансов и учета», «Гуманитарных и социальных наук».
На уровне магистратуры обучение осуществляется в течение 2 лет по всем специальностям. В период обучения студенты изучают основные и дополнительные предметы по специальности. Наконец, магистранты защищают диссертацию и получают степень магистра.
Кафедру возглавляет доцент Шабанов Зейнаддин Мусанниф оглы.